Na czele całej organizacji Legion Maryi stoi centralna rada Legionu tzw. Concilium Legionis Mariae (łac. concilium = zejście się, narada, zgromadzenie) – z siedzibą w Dublinie (Irlandia).
Członkami jej są osoby pełniące funkcje w radach Legionu podporządkowanych bezpośrednio Konsylium, członkowie zarządu Kurii miasta Dublina (bez przedstawicieli Kurii młodzieżowych), Prezydenci prezydiów należących bezpośrednio do Concilium oraz korespondenci Concilium.
Concilium łączy rady legionowe całego świata, ponosi odpowiedzialność za działanie Legionu, troszczy się o współpracę rad oraz o rozwój i popularyzację Legionu w świecie.
Jedynie Concilium ma prawo ustanawiać, zmieniać lub znosić reguły i zasady, na jakich opiera się Legion.